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十九世纪末期，西方列强入侵，中国饱受欺凌与战祸，面临存亡。满清政府虽力图振作，奈因积习太深，未竟成功。孙中山先生为挽救国家危亡，倡导革命，号召志士推翻满清。海外侨胞热烈响应，捐输或投入革命行列，前仆后继，卒建立中华民国。孙中山先生感于华侨爱国爱乡伟大情操，赞誉“华侨为革命之母”。
日寇侵华，中国人民以弱搏强，抗日战争，为攸关中华民族存亡之圣战。时任国民党秘书长吴铁城，受命往南洋募款抗日，侨胞热烈响应，出钱出力，全力支持。吴氏深感民族情怀，联同马超俊等五十二人，于一九四二年五月十一日在重庆创立“南洋华侨协会”，吴铁城为首任会长。
国民党迁入台湾后。1953年，吴铁城心脏病发而逝世。
国民党元老马超俊先生接任理事长，敦促落实“奖励华侨回台投资”方案，卒于1955年10月19日，颁布吸引华侨投资条例，当时支持国民党政府的各地华侨踊加入经济建设台湾行列；并慷慨捐款，在台北市敦化北路现址筹建华侨会馆，1969年落成，为该会务发展奠定基础。
1973年，马超俊任满，高信接任第三任理事长，继续鼓励海外华侨到台湾投资，发展高科技工业，这时台湾能登上亚洲四小龙之首，与海外华侨支持是分不开的。
1993年，张希哲接任第四任理事长，他强化对华侨问题的研究成果，并拓展两岸交流。任内与中央研究院近代史研究所合办“华侨与国父孙中山先生领导之国民革命”，与中国华侨历史学会合办“华侨与抗日战争”等学术研讨会；同时，引介学者加入该会，注入新血，提升会员素质。此外，学编印《华侨大辞典》及华侨丛书。
2000年换届改选，前“监察委员”、美国资深侨领梅培德接任第五任理事长，继于2004年连任。梅培德以“扩建据点，服务侨胞，凝聚侨心”为要务，除积极整顿内部，举办华侨学术讲座外，并致力建立海外服务与联系侨胞据点，先后于美国、加拿大、澳洲及法国等地成立十二个分会；2005年5月率团赴伦敦参加英国分会成立大会时，不幸病逝于旅途。
2005年6月，伍世文先生接任理事长，伍世文曾任台湾“海军总司令”、“国防部部长”等要职，与海外侨社关系极为密切。伍世文接任后，扩大会务参与，举办“侨胞与抗日”座谈会、侨生座谈会、出版郑和下西洋专书、拜访澳门分会、组团前往南洋访问侨社。此外，规划加强与返台就学侨生、归侨及世界各地分会联系，巩固情谊，致力把协会办成团结全球侨胞的总枢纽。。
 附：华侨协会总会世界各地分会一览表
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